Study programme

Molekularna genetika u animalnoj proizvodnji (144552)

ECTS 6.00
English language R1
E-learning R2
Teaching hours 60
Lectures 32
Laboratory exercises 24
Seminar 4
Lecturer
Assoc. Prof. Jelena Ramljak, PhD
Associate teacher for exercises
Valentino Držaić, PhD
Associate teacher for seminars
Assoc. Prof. Jelena Ramljak, PhD
Grading
Sufficient (2) 60-70%
Good (3) 71-80%
Very good (4) 81-90%
Excellent (5) 91-100%

Course coordinator

Assoc. Prof. Jelena Ramljak, PhD
Assoc. Prof. Jelena Ramljak, PhD

Course description

Suvremena animalna proizvodnja koristiti prednosti molekularne genetike koja zahvaljujući razvoju analitičke metodologije pruža velike mogućnosti izgradnje proizvodnih potencijala pasmina. Studente diplomskog studija važno je upoznati s molekularnom genetikom i osposobiti ih za temeljni rad u laboratoriju. Studenti će upoznati osnove molekularne genetike, reakcije PCR, protokole DNA izolacije, načela odabira začetnih oligonukleotida, postupke pripreme i ugađanja PCR reakcije. Dobit će saznanja o genetskoj raznolikosti, čimbenicima koji pridonose povećanju ili smanjenju genetske raznolikosti te načinima očuvanja iste. Upoznat će osnove kartiranja genoma, kroz seminare upoznati temeljne genetske baze podataka. U poglavlju o selekciji potpomognutoj genskim markerima studenti će se upoznati s markerskim sustavima i markerima vezanim za proizvodnju mlijeka i mesa, nasljedne bolesti, plodnost, zdravlje i druga ekonomski značajna svojstva goveda, svinja, ovaca, koza, konja i peradi. Upoznat će načela genetske identifikacije i preporučenih markerskih setova po vrstama domaćih životinja, ugradnju molekularnih podataka u programe konzerviranja genoma, načela molekularno genetskih studija, te mogućnosti transgeneze u animalnim znanostima. Kroz laboratorijske vježbe upoznat će praktični rad u molekularno-genetskom laboratoriju.

Type of course

General competences

Predmet osposobljava studenta za razumijevanje osnovnih genetskih pojmova, evolucijskih procesa i njihovog utjecaja na genetsku raznolikost jedinke, populacije, odnosno na animalnu proizvodnju, općenito. Studenti dobivaju neophodna teorijska i praktična znanja za rad u molekularno-genetskom laboratoriju.

Types of instruction

  • Laboratorijske vježbe
    Laboratorijske vježbe izvode se u jednog grupi od 3 do 5 studenata u cilju stjecanja praktičnih znanja o molekularnoj genetici u animalnoj proizvodnji. Izvodi se pet vježbi iz izolacije DNA, inkubacije DNA, PCR reakcije i genotipizacije.
  • Predavanja
  • Seminari
    Seminar je vezan interpretaciju konkretnih podataka genetske raznolikosti pojedinih vrsta domaćih životinja, kao i preporučenih metoda njihovog očuvanja i konzervacije. Sstudenti samostalno izrađuju i prezentiraju seminare.

Learning outcomes

Learning outcome Evaluation methods
Koristiti dostignute sposobnosti praktičnog učenja u stjecanju novih spoznaja genetske karakterizacije iz područja animalnih znanosti i mljekarstva Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni ispit
Prepoznati prednosti i nedostatke uporabe molekularne genetike u domeni uzgoja životinja i proizvodnje animalnih proizvoda. Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni ispit, seminarski rad
Primjenom genetskih biljega analizirati konkretne probleme u praksi i rješavati ih u novim situacijama na temelju stečenih znanja i vještina. Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni ispit, seminarski rad
Prezentirati suvremene trendove u domeni uzgoja životinja i proizvodnji animalnih proizvoda uporabom molekularne genetike i određivanja genotipova. Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni ispit
Sudjelovati u istraživačkim aktivnostima, procesima razvoja novih tehnologija i proizvoda (planiranje slijeda radnih postupaka prilikom izolacije DNA, provođenja PCR reakcije i genotipizacije u molekularno-genetskom laboratoriju, itd.). Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni ispit
Koristiti suvremenu informacijsko-komunikacijsku tehnologiju i bio-informatičke programske pakete (Genepop, F-stat, TreeView, itd.) u svakodnevnom radu. Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni
Provoditi praktičnu i teorijsku nastavu, donositi zaključke i činjenice te prenositi znanje o uporabi genetike iz područja animalnih znanosti i mljekarske struke. Rasprave tijekom nastave, kolokvij, pismeni i usmeni

Working methods

Teachers' obligations

Izložiti predviđeni program predavanja na jednostavan i studentima razumljiv način
Provesti predviđeni program laboratorijskih vježbi.
Dodijeliti teme seminara i pomoći studentima pri pronalaženju literature i pripremi seminara
Procijeniti u kojoj su mjeri studenti usvojili obrazovne ciljeve te ostvarili ishode učenja modula te prema tome ocijeniti studente koristeći tehnike ispitivanja u obliku postavljenih pitanja kombinacijom pismenog i usmenog ocjenjivanja (ocjene od nedovoljan (1) do odličan (5))

Students' obligations

Pohađati predviđeni program predavanja i usvojiti programom predviđena znanja
Aktivno sudjelovati u raspravi na predavanjima i tijekom izvođena vježbi te prilikom izlaganja seminarskih radova
Pripremiti i prezentirati dodijeljene teme seminarskih radova
Pristupiti polaganju parcijalnih ispita ili završnom pismenom ispitu kao uvjetu za polaganje usmenog završnog ispita

Methods of grading

Evaluation elements Maximum points or Share in evaluation Grade rating scale Grade Direct teaching hours Total number of average student workload ECTS
Pohađanje predavanja 32 32 1,1
Aktivno sudjelovanje na predviđenim vježbama 24 48 1,6
Seminarski rad (priprema + prezentacija) 12% <5
5
6-7
8-9
10
Insufficient (1)
Sufficient (2)
Good (3)
Very good (4)
Excellent (5)
4 12 0,4
Pismeni ispit 1. 24% <60%
60-70%
71-80%
81-90%
91-100%
Insufficient (1)
Sufficient (2)
Good (3)
Very good (4)
Excellent (5)
0 24 0,8
Pismeni ispit 2. 24% <60%
60-70%
71-80%
81-90%
91-100%
Insufficient (1)
Sufficient (2)
Good (3)
Very good (4)
Excellent (5)
0 24 0,8
Završni usmeni ispit 40% <60%
60-70%
71-80%
81-90%
91-100%
Insufficient (1)
Sufficient (2)
Good (3)
Very good (4)
Excellent (5)
40 1,3
UKUPNO 100% 60 180 6
Evaluation elements Description Deadline Recoupment
Seminarski rad (priprema + prezentacija) Seminarski radovi vezani su uz sadržaj modula, a teme ponuđene studentima da ih mogu sami odabrati i prezentirati pojedinačno. Ocjenjuje se izgled i struktura prezentacije, govorničke vještine, razumijevanje sadržaja i način prezentiranja studenta. Nije moguć ispravak putem naknadnog pristupa.
Pismeni ispit 1. Prvi pismeni ispit održat će se nakon dijela gradiva. Moguć je jedan ispravak tijekom redovnog ili izvanrednog ispitnog roka.
Pismeni ispit 2. Drugi pismeni ispit održat će se nakon dijela gradiva. Moguć je jedan ispravak tijekom redovnog ili izvanrednog ispitnog roka.
Završni usmeni ispit Uvjet za polaganje završnog ispita su položeni 1. i 2. pismeni ispit. Studenti koji nisu položili pismene testove, pišu završni pismeni ispit iz cijelog gradiva prije usmenog. Redoviti ili izvanredni ispitni rokovi tijekom akademske godine.

Weekly class schedule

  1. Uvodno predavanje; P – upoznavanje s osnovnim pojmovima u genetici, pravilima nasljeđivanja i evolucijskih procesa.
  2. PCR reakcija; P – protokoli i slijed reakcija u lančanoj reakciji polimerazom. Analitičke metode u molekularnoj genetici V – upoznavanje rada u molekularno-genetskom laboratoriju.
  3. Osnove rada u molekularno-genetskom laboratoriju; P – tehnike i metode rada u molekularno-genetskom laboratoriju. Osnove rada u molekularno genetskom laboratoriju; V – praktični dio.
  4. Prikaz rada u laboratoriju; V – izolacija DNA.
  5. Prikaz rada u laboratoriju; V – reakcija lančanom polimerazom (PCR) reakcija, genotipizacija.
  6. I međuispit: pismeni; Polimorfizam bjelančevina i krvnih grupa, molekularna genetika u filogenetskim studijama (P); primjer uporabe mikrosatelita u filogenetskim odnosima različitih pasmina goveda, konja, koza i ovaca (V).
  7. Selekcija potpomognuta genetskim markerima; P – vrste markerskih sustava; genske karte, selekcija potpomognuta genetskim markerima (MAS); S – prezentacija seminara studenata po odabranim temama.
  8. Molekularna genetika – adaptabilnost i sljedivost proizvoda (P).
  9. Molekularna genetika u govedarstvu (P)
  10. Molekularna genetika u filogenetskim studijama – mtDNA; P – što je i kako se nasljeđuje mt DNA, mtDNA različitih vrsta domćih životinja, polimorfizam mtDNA.
  11. Molekularna genetika u konjogojstvu (P); bolesti s genetskim uzrokom kod konja (V).
  12. Molekularna genetika u funkciji prevencije nasljednih bolesti; P – molekularna genetika u funkciji prevencije nasljednih bolesti; S - prezentacija seminara studenata po odabranim temama.
  13. Transfer gena, transgene životinje; P – genetski inženjering, genetski modificirani organizmi (GMO), kloniranje, Zakonska regulativa; V – primjena zakonskih okvira u biotehnologijama, zakonska regulativa i GMO.
  14. Molekularna genetika – primjena u ovčarstvu i kozarstvu i svinjogojstvu; V – genetska karakterizacija pojedinih pasmina, geni za svojstva od interesa (plodnost, mesnatost, kakvoća mesa, veličina legla, ), QTL lokusi.
  15. Zaključno predavanje / II međuispit (kolokvij 2). Ispitni rok, završni ispit (usmeni).

Obligatory literature

  1. Predavanja i PowerPoint prezentacije (Merlin sustav e-učenje).
  2. Griffiths, A.J.F., Wessler, S. R., Lewontin, R. C., Gelbart, W. M., Suzuki, D.T., Miller, J.H. (2005). Introduction to genetic analysis. -8th ed., New York: W.H. Freeman and Company.
  3. Ivanković, A. (2005). Uporaba molekularne genetike u animalnoj proizvodnji. –u: Stočarstvo 59 (2), 121-144.

Recommended literature

  1. Alcamo, I.E. (2001). DNA Technology – The Awesome Skill. - 2nd ed., London: Academic Press.
  2. Reece, R.J. (2004). Analysis of Genes and Genomes. West Sussex: John Wiley &amp; Sons Ltd.
  3. Allendorf, F.W., Luikart, G.H. (2007). Conservation and Genetics of Populations. Oxford: Blackwell Publishing Ltd.

Similar course at related universities

  • Evolucijska Biologija, Molekularna genetika, Prirodoslovno matematički fakultet Biološki odsjek, Sveučilište u Zagrebu.
  • Molekulska biologija genov, Biotehnologija živali, Kvantitativna genetika in osnove selekcije, Biotehniška Fakulteta, Univerza v Ljubljani.
  • Molekularna genetika i histologija domaćih i gajenih životinja, Poljoprivredni Fakultet, Univerzitet u Beogradu.