Biljna biokemija (64679)
Course coordinator
Course description
Modul daje prikaz osnovnih metaboličkih procesa u biljaka i njihovu regulaciju. Modul također obuhvaća i poglavlja o sekundarnim metabolitima biljaka, membranskom prijenosu, biljnim hormonima, te prijenosu genetičke informacije u eukariota. Laboratorijske vježbe uključuju spektrofotometrijsko određivanjanje fotosintetskih pigmenata, određivanje fotokemijske aktivnosit kloroplasta, utjecaj pH i temperature na enzimsku aktivnost, te određivanje vitamina C.
Type of course
- Diplomski studij / Hortikultura / Povrćarstvo (Compulsory course, 1 semester, 1 year)
 - Diplomski studij / Hortikultura / Vinogradarstvo i vinarstvo (Compulsory course, 1 semester, 1 year)
 - Diplomski studij / Hortikultura / Voćarstvo (Compulsory course, 1 semester, 1 year)
 - Diplomski studij / Hortikultura / Ukrasno bilje (Compulsory course, 1 semester, 1 year)
 - Diplomski studij / Biljne znanosti (Compulsory course, 1 semester, 1 year)
 
ECTS: 6.00
English language: L1
                                Teaching hours: 60
Lectures: 52
Laboratory exercises: 8
                                
Associate teacher for exercises
- Slaven Jurić, PhD
 - Marko Viskić, PhD
 
Grading
                                    Sufficient (2): 60-70%
                                    Good (3): 71-80%
                                    Very good (4): 81-90%
                                    Excellent (5): 91-100%
                                
General competencies
Predmet omogućuje razumijevanje osnovnih biokemijskih procesa u biljaka potrebnih za stjecanje stručnih znanja i rješavanje problema u praksi.
Types of instruction
- Predavanja
 - Laboratorijske vježbe
Izvode se četiri vježbe, a provode se u skupinama od po 10 studenata (deset skupina po 10 studenata). 
Learning outcomes
| Learning outcome | Evaluation methods | 
|---|---|
| Iskazati temeljne pojmove bioenergetike | Pismeni ispit | 
| Objasniti proces fotosinteze | Pismeni ispit | 
| Objasniti metabolizam ugljikohidrata i lipida u biljaka | Pismeni ispit | 
| Objasniti primarni metabolizam dušika i proces asimilacije sulfata u biljkama | Pismeni ispit | 
| Objasniti ulogu sekundarnih biljnih produkata | Pismeni ispit | 
| Objasniti osnovne mehanizme prijenosa molekula i iona kroz biološke membrane | Pismeni ispit | 
| Opisati ulogu biljnih hormona i objasniti mehanizme prijenosa hormonske poruke | Pismeni ispit | 
Working methods
Teachers' obligations
Redovito izvođenje nastave, održavanje konzultacija, održavanje ispita u objavljenim terminima, vođenje evidencije o uspješnosti studenata na parcijalnim ispitima ili završnom ispitu.
Students' obligations
Uredno pohađanje nastave (predavanja + laboratorijske vježbe), pristupiti parcijalnim ispitima ili završnom ispitu iz modula.
Methods of grading
| Evaluation elements | Maximum points or Share in evaluation | Grade rating scale | Grade | Direct teaching hours | Total number of average student workload | ECTS | 
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pohađanje nastave (predavanje + vježbe) | 56 | 56 | 2 | |||
| Parcijalni ispit 1 (PI-1) | 50% | 
                                               
                                               60-70% 71-80% 81-90% 91-100%  | 
                                            
                                                
                                                Sufficient (2) Good (3) Very good (4) Excellent (5)  | 
                                            2 | 62 | 2 | 
| Parcijalni ispit 2 (PI-2) | 50% | 
                                               
                                               60-70% 71-80% 81-90% 91-100%  | 
                                            
                                                
                                                Sufficient (2) Good (3) Very good (4) Excellent (5)  | 
                                            2 | 62 | 2 | 
| UKUPNO | 100% | PI-1 + PI-2 | 60 | 180 | 6 | 
| Evaluation elements | Maximum points or Share in evaluation | Grade rating scale | Grade | Direct teaching hours | Total number of average student workload | ECTS | 
|---|---|---|---|---|---|---|
| Završni ispit | 100% | 
                                               
                                               60-70 71-80 81-90 91-100  | 
                                            
                                                
                                                Sufficient (2) Good (3) Very good (4) Excellent (5)  | 
                                            0 | 124 | 4 | 
| Evaluation elements | Description | Deadline | Recoupment | 
|---|---|---|---|
| Parcijalni ispit 1 (PI-1) | Prvi parcijalni ispit polaže se u 9. tjednu nastave. | ||
| Parcijalni ispit 2 (PI-2) | Drugi parcijalni ispit polaže se u zadnjem tjednu predavanja. | ||
| Završni ispit | Studenti koji kolegiji nisu položili putem parcijalnih ispita polažu završni ispit. | 
Weekly class schedule
- Energetika biokemijskih reakcija / Kinetika i regulacija enzimske aktivnosti P: Gibbs-ova slobodna energija, standardna promjena slobodne energije reakcije, visokoenergijske veze, kopulirane reakcije, Michaelis-Menten-ova jednadžba,. L: određivanje fotosintetskih pigmenata spektrofotometrijskom metodom
 - Kinetika i regulacija enzimske aktivnost P: inhibicija enzima, regulacija enzimske aktivnosti, mehanizmi enzimske katalize, L: Faktori koji utječu na enzimsku aktivnost
 - Primarni metabolizam ugljikohidrata P: glikoliza, glukoneogeneza, put pentoza-fosfata, L: Hill-ova reakcija
 - Primarni metabolizam ugljikohidrata P: Krebsov ciklus, oksidacijska fosforilacija: enzimski kompleksi i prijenos elektrona, L: Određivanje vitamina C
 - Fotosinteza P: fotosintetski pigmenti, građa fotosintetskog aparata, reakcije ovisne o svjetlu, fotofosforilacija
 - Fotosinteza / Oligosaharidi i polisaharidi P: Calvin-ov ciklus, fotorespiracija, put C4-biljaka, biosinteza saharoze
 - Oligosaharidi i polisaharidi / Lipidi P: građa polisaharida, biosinteza škroba, biosinteza strukturnih ugljikohidrata, građa lipida, biosinteza masnih kiselina, razgradnja lipida, biosinteza membranskih lipida
 - Primarni metabolizam dušika P / 1. parcijalni ispit: redukcija nitrata, asimilacija amonijaka, biosinteza aminokiselina
 - Primarni metabolizam dušika / asimilacija sulfata P: fiksacija dušika, skladišni proteini, biosinteza klorofila, asimilacija sulfata
 - Sekundarni biljni produkti P: funkcija sekundarnih metabolita, izoprenoidi, fenilpropanoidi, neproteinske aminokiseline, amini, glukozinolati, betalaini, alkaloidi
 - Biljne membrane / biljni hormoni P: građa membrane, pasivni i aktivni transport kroz membranu, mehanizam prijenosa hormonske poruke
 - Biljni hormoni / Replikacija, transkripcija i translacija genetičke poruke P: auksini, giberelini, citokinini, abscisinska kiselina, eten, struktura nukleinskih kiselina i nukleoproteina, replikacija DNA
 - Replikacija, transkripcija i translacija genetičke poruke P / 2.parcijalni ispit: transkripcija i translacija genetičke poruke u eukariota, posttranslacijske modifikacije, regulacija ekspresije gena, razgradnja proteina.
 - *
 - *
 
Obligatory literature
- J. M. Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer, Biokemija, Školska knjiga, Zagreb, 2013., odabrana poglavlja
 - P. Karlson, Biokemija, Školska knjiga, Zagreb, 1993., odabrana poglavlja
 - Predavanja i nastavni materijali
 
Recommended literature
- H.-W. Heldt, B. Piechulla, Plant biochemistry, Elsevier, Amsterdam, 2011.
 - P. M. Dey, J. B. Harborne, Plant biochemistry, Academic Press, 1997.
 
