Obrana teme doktorskog rada :: Mario Shihabi, mag. ing. agr.

Inbriding i selekcija na X kromosomu u populacijama domaćih životinja / Inbreeding and selection on the X chromosome in domestic animal populations
3.2.2023. u 12:00 sati, Mala vijećnica Sveučilišta u Zagrebu Agronomskog fakulteta te putem Zoom poveznice

Zoom poveznica: https://us06web.zoom.us/j/84441113455?pwd=cTNxK1NrR1VIY0UyZkdQa2x4RkRuQT09 

Predloženi mentor:

  • prof. dr. sc. dr. h. c. Ino Čurik, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet

Povjerenstvo za ocjenu teme doktorskog rada:

  • prof. dr. sc. Vlatka Čubrić Čurik, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet
  • izv. prof. dr. sc. Maja Ferenčaković, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet
  • prof. dr. sc. Luboš Vostry, Czech University of Life Sciences Prague

Sažetak:
Težnjom ka većoj produktivnosti, inbriding i selekcija, stalna su pojava u populacijama domaćih životinja. Dosad, genomski inbriding i signali selekcije uglavnom su se zasnivali na autosomima, zanemarujući X kromosom, unatoč njegovom utjecaju na mnoga ekonomski i evolucijski važna svojstva. Nadalje, PAR (Pseudo-Autosomalna Regija), kao jedinstven segment potencijalno uzrokovan silama koje favoriziraju rekombinaciju, nikad nije ispitivan. Stoga, na SNP čip podacima, u populaciji Labrador pasa i meta-populaciji hrvatskih ovaca procijenit će se inbriding na X kromosomu i PAR-u te usporediti sa autosomalnim inbridingom. Specifičnost X kromosoma je hemizigotnost mužjaka koja pruža točne informacije o haplotipovima. Slijedom toga, na temelju razlike u bogatstvu haplotipa ustanovit će se nova metoda za identifikaciju selekcije i testirat na meta-populaciji hrvatskih ovaca, usporedbom s drugim metodama. Dobiveni rezultati naglasit će važnost uključivanja X kromosoma dok će nova metoda otvoriti nove puteve za istraživanje i oplemenjivanje domaćih životinja.


Abstract:
In the pursuit of higher productivity, inbreeding and selection are a constant phenomenon in domestic animal populations. To date, genomic inbreeding and selection signals have relied primarily on autosomes and ignored the X chromosome, despite its influence on many economically and evolutionarily important traits. In addition, PAR (Pseudo-Autosomal Region) has never been studied because it is a unique segment that may be caused by forces that favour recombination. Therefore, SNP chip data will be used to evaluate inbreeding on the X chromosome and PAR in the population of Labrador dogs and the metapopulation of Croatian sheep and compare it with autosomal inbreeding. The specificity of the X chromosome is male hemizygosity, which provides accurate haplotype information. Consequently, based on the differences in haplotype richness, a new selection identification method will be developed and tested on a metapopulation of Croatian sheep in comparison with other methods. The results obtained will underline the importance of including the X chromosome, while the new method will open new avenues for research and breeding of domestic animals.

Prijava djelatnika

Mrežna stranica koristi kolačiće (cookies). Kolačiće upotrebljavamo kako bismo personalizirali sadržaj i oglase, omogućili značajke društvenih medija i analizirali promet. Isto tako, podatke o vašoj upotrebi naše web-lokacije dijelimo s partnerima za društvene medije, oglašavanje i analizu, a oni ih mogu kombinirati s drugim podacima koje ste im pružili ili koje su prikupili dok ste upotrebljavali njihove usluge. Nastavkom korištenja naših internetskih stranica vi prihvaćate našu upotrebu kolačića. Polica privatnosti.