Obrana teme doktorskoga rada :: Luka Marinov, mag. ing. agr.
Cjelogenomska asocijacijska studija tolerantnosti na vodni deficit u hrvatskoj germplazmi vinove voze
četvrtak 9.2.2023., 12:00 h :: Agronomski fakultet, Mala vijećnica
Predloženi mentori:
- izv. prof. dr. sc. Toni Safner, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet
- dr. sc. Goran Zdunić, znanstveni savjetnik, Institut za jadranske kulture i melioraciju krša
Povjerenstvo za ocjenu teme doktorskog rada:
- prof. dr. sc. lvan Pejić, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet
- prof. dr. sc. Zlatko Šatović, Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet,
- dr. sc. Marijan Bubola, znanstveni suradnik, Institut za poljoprivredu i turizam Poreč
Sažetak rada:
Hrvatska germplazma vinove loze do sada je dobro istražena na temelju SSR markera, međutim opsežnije proučavanje individualnih genoma i detekcija polimorfizama jednog nukleotida (SNP) i dalje nedostaje. U ovom radu genotipizirati će se 128 kultivara vinove loze (Vitis vinifera L. subsp. vinifera) i 50 jedinki divlje loze (Vitis vinifera L. subsp. sylvestris) upotrebom ciljanog sustava sekvenciranja nove generacije temeljenog na tehnologiji „single primer enrichment technology“.
Genetski odnosi i genetska struktura promatranih jedinki će biti određena na osnovi dobivenih SNP-ova. Dobiveni set SNP-ova će se iskoristiti za identifikaciju gen lokusa povezanih s tolerantnošću na vodni deficit putem odabranog seta fenotipskih podataka i cijelogenomske studije (GWAS). Kvantitativna svojstva analizirat će se uobičajenim statističkim deskriptivnim pokazateljima. Multivarijatnom analizom na temelju fizioloških pokazatelja uradit će se grupiranje genotipova.
Statističke analize će se provesti korištenjem R računalnog programa.