Integrativna analiza signalnih puteva fitohormona uključenih u odgovor biljaka krumpira na infekciju viroidom vretenastoga gomolja krumpira (PotatoSignalHub)
Naziv natječaja: Hrvatska zaklada za znanost
Izvor financiranja: Hrvatska zaklada za znanost
Uloga AFZ: partner
Ukupna vrijednost: 1 000 000,00 HRK
Financirani iznos: 1 000 000,00 HRK
Početak provedbe: 01.03.2020.
Završetak provedbe: 29.04.2024.
Sažetak
Viroid vretenastoga gomolja krumpira (Potato spindle tuber viroid, PSTVd) je najvažniji subviralni patogen krumpira (Solanum tuberosum L.). Zbog široke rasprostranjenosti u svijetu i patogenog učinka na mnoge poljoprivredne kulture, zaraza viroidom PSTVd može predstavljati ograničenje u proizvodnji hrane. Molekularni mehanizmi kojima viroidi induciraju kompleksne promjene u ekspresiji gena i metabolizmu biljaka domaćina nisu u potpunosti razjašnjeni. Novija saznanja ukazuju da fitohormoni posreduju u regulaciji mnogih signalnih putova uključenih u interakciju biljaka i viroida.
Glavni cilj ove studije je analizirati dinamiku odgovora biljaka krumpira na infekciju viroidom PSTVd kako bi dobili uvid u fitohormonima-posredovane odgovore na infekciju i pojasnili ulogu fitohormona u razvoju simptoma. U ovoj studiji provest ćemo sustavno istraživanje ekspresije gena i endogenih fitohormona kako bi bolje razumjeli fiziološko značenje promjena u statusu fitohormona tijekom napredovanja bolesti.
Doprinos jasmonske kiseline (JA) i salicilne kiseline (SA) u odgovoru na infekciju viroidom PSTVd istražit ćemo koristeći transgenične linije krumpira koje nemaju mogućnost nakupljanja JA i SA, kako bi utvrdili može li nedostatak fitohormona biti povezan sa sistemskim odgovorom i karakteristikama simptoma.
Analizu transkriptoma listova sistemski zaraženih ne-transgeničnih i transgeničnih linija krumpira provest ćemo kako bi dobili detaljan uvid u diferencijalno eksprimirane gene uključene u signalne putove fitohormona i njihove interakcije. Nadalje, promjene u ekspresiji tih gena bit će uspoređene s profilom ekspresije nekih konzerviranih miRNA s ciljem identificikacije miRNA uključenih u modulaciju signalnih putova fitohormona tijekom odgovora krumpira na zarazu viroidom PSTVd.
Nova saznanja mogu pridonijeti boljem razumijevanju kompleksnih interakcija biljaka i viroida te pomoći razvoj strategija za zaštitu biljaka od ovog patogena.
Voditelji
prof. dr. sc. Snježana Kereša
Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet
Suradnici
izv. prof. dr. sc. Ivanka Habuš Jerčić
Sveučilište u Zagrebu Agronomski fakultet