Animalna genetika (185435)
Nositelj predmeta
Opis predmeta
Populacijska i kvantitativna genetika su znanstvene discipline biologije koje omogućavaju analizu genetske strukture i varijabilnosti svojstava u populacijama organizama kao i utjecaje genetičkih i ekoloških čimbenike na promjene svojstava u populacijama. Teorijske spoznaje ovih disciplina imaju praktičnu primjenu u analizi promjena genetske strukture populacija, održavanju/očuvanju bioraznolikosti populacija različitih vrsta organizama. U stočarstvu su od posebnog značaja za razvoj uzgoja i selekcije u populacijama životinja.
Program modula: Uvod (razvoj, značaj i odnos s prirodnim i društvenim disciplinama, terminologija); Genetička konstitucija populacije; Promjene frekvencije gena i genotipova u populacijama (posebno domaćih) životinja; Mala populacija (ΔF, Ft, Fx), Genske mape u stočarstvu; Pojam svojstva, vrijednosti, prosjeci, odstupanja i varijabilnost u populaciji; Varijance i kovarijance; Odnosi varijanci i genetički parametri; Osnovni parametri za selekciju životinja; Inbreeding i križanje (linije u stočarstvu, heterozis). Vježbe se održavaju uz individualni pristup studentu, samostalno rješavanje teorijskih i praktičnih problema u svrhu pripreme za praksu.
Vrsta predmeta
- Prijediplomski studij / Animalne znanosti (Obvezni predmet, 2. semestar, 1. godina)
ECTS: 6.00
Engleski jezik: R1
E-učenje: R1
Sati nastave: 60
Predavanja: 38
Vježbe u praktikumu: 16
Seminar: 6
Izvođač predavanja
- Prof. dr. sc. dr. h. c. Ino Čurik
- prof. dr. sc. Vlatka Čubrić Čurik
- izv. prof. dr. sc. Maja Ferenčaković
- doc. dr. sc. Vladimir Brajković
Izvođač vježbi
Ocjenjivanje
Dovoljan (2): 62-70%
Dobar (3): 71-80%
Vrlo dobar (4): 81-91%
Izvrstan (5): 92-100%
Uvjeti za dobivanje potpisa
Redovito pohađanje nastave >80%
Opće kompetencije
Osposobiti studente u razumijevanju i primjeni teorijskih spoznaja o genetičkoj konstituciji populacija, procesima promjena frekvencije gena i varijabilnosti svojstava jedinki i populacija kao osnove u oplemenjivanju životinja.
Oblici nastave
- Predavanja
Audiovizualna metoda - Vježbe u praktikumu
Izvode se u praktikumu uz individualni pristup studentu i samostalno rješavanje teorijskih i praktičnih zadataka.
Ishodi učenja i način provjere
| Ishod učenja | Način provjere |
|---|---|
| Osnovni genetički pojmovi. | Pismeni međuispit I. |
| Povijesni pregled razvoja animalne genetike. | Pismeni međuispit I. |
| Prepoznati i ocijeniti važnost teorijskih spoznaja fenotipske i genetske varijabilnosti populacija životinja za uzgoj i selekciju životinja. | Pismeni međuispit II. |
| Specificirati genetske parametre u postavljanju uzgojnih ciljeva i selekcijskih programa životinja. | Pismeni međuispit II. |
| Objasniti i primijeniti značaj selekcije životinja u efikasnoj industrijskoj proizvodnji mesa i mlijeka. | Pismeni međuispit III. |
Način rada
Obveze nastavnika
Redovito održavanje nastave.
Obveze studenta
Redovito pohađanje nastave i polaganje pismenih međuispita.
Polaganje ispita
| Elementi praćenja | Maksimalno bodova ili udio u ocjeni | Bodovna skala ocjena | Ocjena | Broj sati izravne nastave | Ukupni broj sati rada prosječnog studenta | ECTS bodovi |
|---|---|---|---|---|---|---|
| svladavanje 1. dijela gradiva | 40% |
0-60% 61-70% 71-80% 81-91% 92-100% |
Nedovoljan (1) Dovoljan (2) Dobar (3) Vrlo dobar (4) Izvrstan (5) |
20 | 60 | 2 |
| svladavanje 2. dijela gradiva | 40% |
0-60% 61-70% 71-80% 81-91% 92-100% |
Nedovoljan (1) Dovoljan (2) Dobar (3) Vrlo dobar (4) Izvrstan (5) |
20 | 60 | 2 |
| svladavanje 3. dijela gradiva | 20% |
0-60% 61-70% 71-80% 81-91% 92-100% |
Nedovoljan (1) Dovoljan (2) Dobar (3) Vrlo dobar (4) Izvrstan (5) |
20 | 60 | 2 |
| Elementi praćenja | Opis | Rok | Nadoknada |
|---|---|---|---|
| svladavanje 1. dijela gradiva | pismeni ispit | redoviti | |
| svladavanje 2. dijela gradiva | pismeni ispit | redoviti | |
| svladavanje 3. dijela gradiva | pismeni ispit | redoviti |
Tjedni plan nastave
- Uvod (P)-Povijesni razvoj, sadašnji značaj, odnos prema drugim prirodnim i društvenim disciplinama, terminologija.
- Genetička konstitucija populacije (P)-Frekvencije gena, genoma, HW-ravnoteža.
- Evolucijski i sustavni procesi u populacijama životinja (P) Promjene frekvencije gena i (adaptivna vrijednost, selekcijski pritisak) i u populaciji.
- Mala populacija (P) - Random drift, subpopulacije, inbreeding.
- Genske mape životinja (P) - Varijabilnost.
- Pojam svojstva i varijabilnost u populacijama (P) - Vrijednost (prosjeci, genski efekti osnova UV) VP, VG, VA, VD, VI.
- Varijance (P) - Odnosi među srodnicima i komponente varijanci, genetički parametri.
- Kovarijance (P) - Kovarijance, genetički parametri.
- Inbreeding i križanje (P) - Inbreeding i križanje (linije u stočarstvu i heterozis).
- Primjena teorijskih spoznaja u rješavanju problema i bioinformatički software-i (V) - Frekvencije gena u populaciji, HW-ravnoteža i testiranje, Promjene frekvencije gena i genotipova u populaciji, genskih efekti, varijance, inbreeding koeficijent. Softver paketi i primjena u rješavanju problema.
- Praktična primjena (problemi) iz populacijske kvantitativne genetike genetike (V) - Frekvencije i promjene frekvencije gena i genotipova kroz generacije.
- Praktična primjena (problemi) populacijske i kvantitativne genetike (V) - Vrijednosti svojstava u populaciji, genski efekti.
- Praktična primjena (problemi) populacijske i kvantitativne genetike.(V)- Varijance, kovarijance, koeficijent inbreedinga, heterozis
- Dostignuća istraživanja u populacijskoj genetici (P) - Linije u stočarstvu i uzgoj; Praktična primjena softver paketa u rješavanju problema izračuna frekvencija gena i genotipova i drifta (V).
- Praktična primjena softver paketa u rješavanju problema izračuna varijance, kovarijance i inbreedinga (V)
Obvezna literatura
- Meneely, P. (2009): Advanced genetic analysis genes, genomes, and networks in eukaryotes. Oxford Univ. Press, Oxford, UK.
- Falconer, D.S. , Mackay, T. (1996): Introduction to Quantiative genetics; Ed, Logman group Ltd.
- Đikić, M. (2012): Populacijska i kvantitativna genetika – odabrana poglavlja (skripte, predavanja) Zavod za opće stočarstvo, Agronomski fakultet Sveučilišta u Zagrebu, str. 60.
- Prezentacije predavanja (400 slide-ova), autor Vlatka Čubrić Čurik
Preporučena literatura
- Griffths, A.J.F., Wessler, S.R., Lewontin, R.C., Gelbart, W.M., Suzuki, D.T., Miller, J.F. (2005): Introduction to genetics analysis; Ed. W.H.Freeman and Company, New York, USA.
- Lynch, M., Walsh, B. (1998): Genetic and Analysis of Quantative traits, Ed. Sinauer Associates, Inc. Publish. Sunderland, Massachusetts, USA.
- Kimura, M. (1994): Population genetics, molecular evolution and the neutral theory; Ed. University of Chichago press, Chichago, USA, London, UK.
- Publikacije baza podataka CC, CAB i dr. o najnovijim spoznajama i istraživanjima iz populacijske i kvantitativne genetike te genomike i proteomike.
Sličan predmet na srodnim sveučilištima
- Qantitative and population Genetics (GG201D), Cornell University
- Principles of animal genetics (ANSC 2210) Cornell Univresity USA
- Pinciples of population Biology, (PGB, 200A, 200B, 200C) UC Davis University, USA
- Evolutionary genetics and phylogeny“ University of Reading, UK